El ecosistema de bosque andino comienza más o menos entre los 1.000 y 1.200 msnm, por encima del nivel de la selva húmeda tropical y de los bosques tropicales secos. Se encuentran distribuidos a lo largo de las tres cordilleras donde se ha visto fragmentado por la intervención de sistemas agropecuarios hasta en un 50%. Muchos de estos bosques quedan como relictos y se encuentran más que todo en las cuencas del Sinú-Caribe, Caquetá, Meta, Patía, río Catatumbo, alto y medio Magdalena, medio Cauca, río Atrato y la sabana de Bogotá; dentro de este tipo de ecorregión está el bosque sub–andino, también distribuido en las tres cordilleras, la Sierra Nevada de Santa Marta, la Sierra de la Macarena y la Serranía del Darién.
Acorde a la Corporación Autónoma Regional de Cundinamarca (CAR), en Colombia sólo queda un 4% del bosque andino, una de las mayores pérdidas ecosistémicas del país, la región Andina es la más poblada y económicamente activa, lo que ha fragmentado sus bosques y hoy sólo representan 20% de la cobertura inicial.